Ao entrar no museu, é possível observar que a organização do espaço é impecável. Há diversas salas com exposições temáticas, que cobrem desde a época da colonização até os dias atuais. Uma das primeiras salas é dedicada aos primeiros conflitos militares que ocorreram na região, como a Guerra Guaranítica e as invasões espanholas. Há também uma seção que apresenta a história da Revolução Farroupilha, um importante movimento separatista que ocorreu no século XIX.

Conforme se avança pelas salas, é possível observar a evolução das forças armadas do Brasil e do Comando Militar do Sul, através de exposições de uniformes, armas, equipamentos e objetos históricos. Há também uma seção dedicada à participação do Brasil na Segunda Guerra Mundial, com destaque para a Força Expedicionária Brasileira.

Além das exposições, o museu conta com um acervo de documentos históricos, como cartas, mapas, diários e fotografias, que ajudam a contextualizar os eventos e a entender melhor a história militar do Brasil. Os visitantes também têm a oportunidade de interagir com alguns equipamentos e objetos expostos, o que torna a visita ainda mais interessante e envolvente.